Il luglio del 1999 nasce il New Genoa Calcio Femminile.  Il nome “New” fu aggiunto per volontà della FIGC che non voleva si creassero incompatibilità con la società professionistica maschile. Ma fu proprio il Genoa CFC 1893, a suggellare il nome definitivo in Genoa Calcio Femminile 1999. La definitiva consacrazione fu sancita nella stagione 2000/2001, durante la presentazione fatta insieme alla società dell’allora presidente Dalla Costa con diversi giocatori (ricordiamo il mitico Francioso) e dirigenti del Grifone. I locali che ospitarono lo storico incontro erano quelli degli Estoril di Corso Italia
In quella occasione è divertente ricordare anche una mini partitella fatta tra alcuni campioni rossoblù e alcune giocatrici della femminile.

L’intuizione di costruire una società di calcio femminile venne al presidente Raffaele Macrì, dopo aver assistito ad una gara di squadre femminili, invitato da Massimo Mechetti

La Società è affiliata al CONI e alla FIGC dal 1999, e da allora partecipa al campionato FIGC, nel 2001 viene fondata la Scuola Calcio Femminile Genoa,  nel 2010 la soc. conta 120 atlete tesserate, con 9 squadre iscritte ai campionati Federali, N. 20 fra Dirigenti Tecnici ed Educatori, N. 12 fra Collaboratori e Talent scout. Un vero record per il calcio femminile